6 | FORSKNING / RESEARCH | NR. 3·2017 Genteknologi kan aflure jungleplanternes metoder AMAZONAS Et nyt forskningsprojekt fra DTU Bioinformatik skal kortlægge genetikken bag regnskovens potente plantestoffer og gøre dem tilgængelige for forskning og industri. Gene technology can unravel jungle plants’ methods AMAZONAS The temperature is boiling hot. The air humidity is close to the 100 per cent and we are wearing long trousers and big chunky boots to protect us from aggressive mosquitoes and creepy-crawlies as we move through the jungle. We are on the outskirts of the world’s largest expanse of tropical rainforest— the Amazonas. Despite the presence of huge, hairy, spectacularly coloured spiders and ants the size of matchboxes, we are here to study the plants. For within the mass of interweaving green vegetation there are very likely substances that can treat incurable diseases— substances which the pharmaceutical industry can scarcely dream of. The local guide leads us through the jungle, stopping at each and every tree and growth, explaining at length precisely the plant’s unique gastronomic qualities or medical properties. We are in Brazil with a team of researchers from DTU Bioinformatics to initiate an extremely ambitious project—the genome sequencing of the rainforest’s plant life. “The aim is to utilize all the latest technologies we have at our disposal (next-generation sequencing, proteome, metagenome and metabolomics analysis as well as fluorescence spectroscopy) to explore and preserve the rainforest’s incredible biodiversity and genetic wealth before it’s too late,” explains Professor Thomas Sicheritz-Pontén, who is heading the project. Af Iben Julie Schmidt Det er kogende varmt. Luftfugtigheden er tæt ved de 100 procent, og vi er iført lange bukser og store kraftige støvler for at beskytte os mod aggressive myg og kryb, mens vi bevæger os gennem junglen. Vi befinder os i udkanten af verdens største regnskovsområde, Amazonas. Selvom kæmpe lodne edderkopper i smukke farver og myrer på størrelse med tændstikæsker stjæler en del af opmærksomheden, så er det planterne, vi er her for. For i alt det grønne, der snor sig ind og ud mellem hinanden, findes med stor sandsynlighed stoffer, der kan behandle sygdomme, som vi ikke har nogen kur for i dag, stoffer som lægemiddelindustrien kun tør drømme om. Den lokale guide, der leder os gennem junglen, standser da også ved hver eneste vækst og fortæller lange historier om netop denne plantes specielle gastronomiske kvaliteter eller medicinske egenskaber. Vi er i Brasilien med et forskerhold fra DTU Bioinformatik for at starte et meget ambitiøst projekt: At gen-sekventere regnskovens planter. „Målet er at bruge alle de nye teknologier, vi har fået til rådighed (næste generationssekventering, proteom-, metagenom og metabolom-analyse samt fluorescens spektroskopi), til at udforske og bevare regnskovens utrolige biodiversitet og genetiske rigdom, før det er for sent,“ forklarer professor Thomas Sicheritz-Pontén, som leder projektet. For regnskoven er truet. Hvert år forsvinder omkring 25.000 kvadratkilometer af Amazonas, svarende til et areal næsten på størrelse med Jylland. Det sker bl.a. på grund af skovning, som skal frigøre arealer til landbrug. Desværre har netop opdagelsen af regnskovens værdifulde planter til f.eks. medicinsk brug ført til, at visse plantearter i dag er truede. Men netop her er dette projekt afgørende anderledes, fortæller Thomas Sicheritz- Pontén: „Vi behøver ikke mere end et enkelt blad eller en skefuld jord til vores analyser for at kunne kortlægge, hvilke stoffer, planterne producerer, og hvordan de gør det. Vi vil også se på, hvilke mikroorganismer, der findes på og i planterne, da de bidrager til den samlede genpulje. Man kan lidt populært sige, at vi ønsker at aflure planterne deres hemmelige opskrifter, så vi selv kan starte en produktion af de værdifulde stoffer ved hjælp af Birger Lindberg Møller fra KU er ekspert i planters bioaktive naturstoffer. Her sammen med den lokale guide (i grøn skjorte). Birger Lindberg Møller from the University of Copenhagen is an expert in plants’ natural bioactive substances. Pictured with the local guide (green shirt).
DTUavisen1703
To see the actual publication please follow the link above