Page 12

139037_DTU-avisen_5_2013_final_web

Ny søgemaskine finder de sjældne Mest for læger Findzebra.com er åben for enhver; men de artikler, man finder ved at søge i databasen, er på engelsk og skrevet i fagsprog. Derfor er siden udstyret med en advarsel mod at bruge søgemaskinen, hvis man ikke er uddannet læge. Fotos Thorkild Amdi Christensen søgeværktøj   Når man hører lyden af galopperende hove bag sig, vil man umiddelbart tænke, ’der kommer en hest’. Men i sjældne tilfælde er det faktisk en zebra, der nærmer sig. Læger er opdraget til at tænke ’hest’ eller ’almindelig sygdom’, når de møder patienter i deres praksis, og da de i sagens natur sjældent eller aldrig møder ’zebraen’ i form af en sjælden sygdom tager det ofte mange år at nå frem til den rette diagnose. Med et nyt søgeværktøj kaldet FindZebra kan den tid i mange tilfælde minimeres betragteligt. Ole Winther er lektor på DTU Compute, hvor han arbejder med algoritmer og andre matematiske værktøjer, der kan gøre internettet ’klogere’. Han har en overgang været ansat på halvtid på Københavns Universitet, hvor han arbejdede sammen med biologer og medicinere inden for dataanalyse, og det var dette samarbejde, som for tre år siden satte ham i gang med at udvikle FindZebra. „En af vores medicinske samarbejdspartnere kom en dag styrtende ovre fra Rigshospitalet i skjorteærmer, selv om det var midt på vinteren. Han måtte simpelthen bare fortælle os, at det var lykkedes ham at stille en diagnose, som flere ældre professorer havde givet op over for,“ fortæller Ole Winther. „Det vakte min nysgerrighed, og da han afslørede, at han havde taget internettet til hjælp, begyndte jeg at tænke over, hvordan man kunne lave en søgemaskine, som kunne hjælpe læger med at finde frem til diagnoser.“ Målrettet søgning På nettet findes der masser af artikler med beskrivelser af sjældne sygdomme og deres symptomer, nogle lødige og gennemarbejdede, andre mere tilfældige og udokumenterede. Læger bruger ofte en fagmedicinsk artikeldatabase, PubMed, som også har en søgefunktion, men her er det som regel ikke nok at søge på enkelte symptomer – man skal helst også kende navnet på artiklens forfatter eller lignende for at få et brugbart resultat. Søger man med Google, kan man godt være heldig at finde artikler om sjældne sygdomme, men Googles (hemmelige) algoritmer er optimeret efter, hvor mange klik et søgeresultat får. Derfor bliver en gennemsnitssøgning stadig bedre, mens specielle søgninger, for eksempel på sjældne sygdomme, ikke nødvendigvis drager fordel af Google udviklingsarbejde. „Da jeg blev opmærksom på problemet med at finde den rette diagnose med almindelige Google-søgninger, tænkte jeg: ’Det må kunne gøres bedre!’“ fortæller Ole Winther. Han fik sammensat et lille hold til at udvikle en søgemaskine med speciel fokus på sjældne sygdomme. I første omgang blev to bachelorstuderende koblet på opgaven, og senere kom to specialestuderende, Radu Dragusin og Paula Petcu, ind i gruppen. De har samlet materiale om de 6000-8000 kendte og beskrevne sjældne sygdomme fra 10 forskellige sites på nettet. Alle kilderne er udvalgt i samarbejde med overlæge Henrik L. Jørgensen fra Klinisk Biokemisk Afdeling på Bispebjerg Hospital. I alt søger FindZebra i flere end 31.000 artikler; det er en begrænset mængde i forhold til Googles spændvidde, men til gengæld er de alle potentielt relevante for læger, der søger diagnoser på sjældne sygdomme. State of the art En stor del af arbejdet med FindZebra har været at teste søgemaskinen godt og grundigt igennem, og her har Henrik L. Jørgensen også været til stor hjælp med at finde gode testcases, det vil sige sjældne sygdomstilfælde, hvor diagnosen var blevet stillet. „Sjældne sygdomme er defineret ved, at de højst findes hos en ud af 1500 personer, så det er ikke noget, den enkelte læge normalt møder. Når han så står over for en patient, En forsker på DTU Compute har udviklet et søgeværktøj, der kan hjælpe læger med at pejle sig ind på den rette diagnose hos patienter med sjældne sygdomme. „Men vi er jo alle sammen en slags hypokondere, der søger så mange svar som muligt, når vi føler os syge. Og hvis man kan forstå artiklerne i FindZebra, kan man måske også selv hjælpe med til at få stillet en diagnose og dermed eventuelt bane vejen for sin helbredelse,“ siger Ole Winther. Da jeg blev opmærksom på problemet med at finde den rette diagnose med almindelige Googlesøgninger, tænkte jeg: ’Det må kunne gøres bedre! Ole Winthe r, lekt or, DTU Compute 12


139037_DTU-avisen_5_2013_final_web
To see the actual publication please follow the link above